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Master Biologie Végétale Intégrative

Zone de texte éditable et éditée

UE5 : Génétique quantitative

UE5
Dominante : Génétique et Génomique

- Objectifs pédagogiques

L’UE5 a pour objectif de former les étudiants à mettre en œuvre les démarches permettant d’identifier les déterminants génétiques d’un caractère complexe. A l’issue de ce module, les étudiants auront une connaissance des différentes méthodologies existantes et des concepts génétiques sur lesquelles elles sont fondées. Ils seront capables de choisir et mettre en oeuvre ces méthodologies en fonction des informations dont ils disposent (données de génomique, information sur l’étendue du DL, données de phénotypage, type de matériel végétal …)

L’UE4 permet de repositionner les bases de génétique des populations, ainsi que le concept de déséquilibre de liaison nécessaires pour suivre l’UE5. (Selon les établissements d’origine, ces bases sont généralement vues en M1).

- Contenu de l’enseignement (20h)

Cours :
  • Introduction du module et Bases de la génétique quantitative

  • Carte génétique et application

  • Principes et méthodologies de détection de QTL par analyse de liaison : des dispositifs simples (pop biparentales) à des dispositifs plus complexes (pop connectées, IBD-based QTL mapping, … pop outbred)

  • Principes et métholodolgies de génétique d'association et analyses conjointes par liaison et association regional association mapping, genome-wide association mapping, nested association mapping

Conférences :
  • Détection de QTL chez le pommier

  • Exemple de génétique d'association chez le ray-grass

  • Intégration des approches de génétique quantitative et d’écophysiologie

TD :
  • Génétique d’association