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Master Biologie Végétale Intégrative

Zone de texte éditable et éditée

Stages

Liste non définitive des stages proposés par les différents laboratoires d'accueil du master BioVIGPA pour l'année 2016-2017  :

Télécharger l'offre globale de stages

Intitulé du sujet de stage (version française)

Effet de la polyploïdie sur le stress salin chez les spartines : aspects moléculaires et application en ingénierie écologique.

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

CNRS/OSUR UMR6553

Intitulé de l'équipe d'accueil

Evolution, Génomes et Adaptation

Responsable

Malika Aïnouche

Nom, prénom

A. El Amrani, A. Salmon et M. Aïnouche

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

A. El Amrani (MCF)

Adresse

université de Rennes 1 OSUR/CNRS-UMR6553 Equipe: Evolution, Génomique et Adaptation Campus de Beaulieu, Bat. 14 A 35042 Rennes Cedex

Téléphone

02 23 23 51 24

Email

abdelhak.elamrani@univ-rennes1.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Polyploïdie, expression des gènes, stress salin, phytoremédiation, partines

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Le stage aura lieu à l’Université de Rennes 1, au sein de l’équipe Evolution, Génome et Adaptation. Le(a) candidat(e) évoluera au sein d’une équipe pluridisciplinaire. Il abordera des approches de génomique fonctionnelle et comparative, ensuite aura la possibilité de faire le lien avec des observations physiologiques écophysiologiques et cellulaires.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Etude de la voie de signalisation des strigolactones lors de la germination des végétaux supérieurs

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

Laboratoire de Biologie et Pathologie Végétales EA 1157 Université de Nantes

Intitulé de l'équipe d'accueil

Laboratoire de Biologie et Pathologie Végétales

Responsable

Philippe DELAVAULT

Nom, prénom

Philippe DELAVAULT & Guillaume BRUN

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

PR & étudiant en thèse

Adresse

2, rue de la Houssinière BP 92208 44322 Nantes Cedex 3

Téléphone

02 51 12 56 17

Email

philippe.delavault@univ-nantes.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Arabidopsis, plantes parasites, germination, strigolactones, épigénétique

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

La germination des végétaux supérieurs, parasites ou non, peut être activée par une nouvelle classe de phytohormones, les strigolactones. L’objectif principal de ce stage est d’élucider les acteurs impliqués dans la voie de signalisation induite par ces molécules, et ce par des approches moléculaires, pharmacologiques, et de validation fonctionnelle.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Recherche des destinations métaboliques de la proline au cours de la sénescence foliaire chez le colza.

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

Insight into the metabolic destination of proline during leaf senescence in oilseed rape.

Statut de l'Unité de rattachement

UMR 1349 INRA-Agrocampus Ouest-Université de Rennes 1, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP)

Intitulé de l'équipe d'accueil

Rendement sous contraintes abiotiques (RCA)

Responsable

Alain BOUCHEREAU, PR Université de Rennes 1

Nom, prénom

DECHAUMET Sylvain (Marie-Françoise Niogret, Alain Bouchereau)

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

Doctorant

Adresse

Domaine de la Motte, 35650 Le Rheu

Téléphone

02 23 48 59 97

Email

sylvain.dechaumet@inra.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Métabolisme oxydatif, Senescence, Profilage métabolique, Marquage isotopique, Biologie moléculaire

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Pour montrer que la proline n’est pas seulement un composé osmo-induit en condition de stress, mais aussi impliqué dans les processus de vieillissement et de remobilisation chez le colza, le stagiaire utilisera une stratégie intégrative associant profilage métabolique, traceurs isotopiques et biologie moléculaire. L’objectif sera de caractériser les métabolites impliqués dans la dégradation et/ou le transport de la proline dans des conditions de vieillissement contrôlées.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Implication des transporteurs de glucides de la plante dans les interactions biotiques dans la phyllosphère chez le ray-grass anglais

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

UMR EVA – Ecophysiologie Végétale, Agronomie et nutrition NCS

Intitulé de l'équipe d'accueil

Equipe FEAST (Fructanes, Environnement et Transport des Sucres)

Responsable

Annette Bertrand

Nom, prénom

Nathalie Noiraud-Romy - Frédéric Meuriot

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

MCF

Adresse

Université de Caen Normandie, Esplanade de la Paix- CS 14032 - F 14032 Caen Cedex, France

Téléphone

02 31 56 74 22 - 06 86 60 83 89

Email

nathalie.noiraud-romy@unicaen.fr - frederic.meuriot@unicaen.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Lolium perenne, carbone, micro-organismes, transport, régulation.

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Etudier l'implication des transporteurs de glucides de la plante dans les interactions biotiques dans la phyllosphère chez le ray-grass anglais par des approches biochimiques, moléculaires et immunocytochimiques.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Validation fonctionnelle du rôle des transporteurs de saccharose dans la répartition du carbone dans la plante lors d’un déficit hydrique.

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

UMR Université de Poitiers/CNRS

Intitulé de l'équipe d'accueil

SEVE

Responsable

Prof. R. Atanassova

Nom, prénom

POURTAU Nathalie

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

MCF

Adresse

UMR CNRS 7267 Equipe SEVE Sucres, Echange, Végétaux, Environnement, Bât. B31 3, rue Jacques Fort – TSA 51106. F-86073 Poitiers Cedex 9 France

Téléphone

05 49 45 49 31

Email

Nathalie.Pourtau@univ-poitiers.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Racines, Rhizobox, Transporteurs, saccharose, contrainte hydrique

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Le stage se déroulera en appui du travail de thèse d’un doctorant. Les techniques sont toutes maîtrisées au laboratoire et le stagiaire s’intéressera principalement à valider fonctionnellement le rôle de certains transporteurs de saccharose dans la réponse et l’adaptation de la plante à la contrainte hydrique. Il s’agit d’un sujet de biologie intégrative.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Caractérisation de peupliers transgéniques affectés pour les propriétés du bois par imagerie ATR-FTIR

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

AGPF - UR INRA

Intitulé de l'équipe d'accueil

Physiologie moléculaire de la formation du bois

Responsable

Annabelle Déjardin

Nom, prénom

Laurans, Françoise

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

IR

Adresse

2163 Avenue de la Pomme de Pin CS 40001 Ardon 45075 ORLEANS Cedex

Téléphone

02 38 41 78 22

Email

francoise.laurans@orleans.inra.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Peuplier, bois, microscopie, paroi cellulaire, imagerie MIR

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Le stage consistera à caractériser finement des peupliers génétiquement modifiés pour des gènes impliqués dans la formation du bois. L’étudiant mettra en œuvre des techniques d’imagerie par spectroscopie ATR-FTIR et par immunolocalisation pour mettre en évidence des différences entre lignées au niveau des parois cellulaires des cellules de bois.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Caractérisation du gène de défense LONG1 dans la longévité des graines de Medicago truncatula

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

INRA

Intitulé de l'équipe d'accueil

CONSERTO

Responsable

Julia Buitink

Nom, prénom

Souha Berriri / Julia Buitink

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

Post doc

Adresse

INRA Angers-Nantes Pays de la Loire 42 rue Georges Morel CS 60057 F - 49071 Beaucouzé Cedex

Téléphone

0249180477

Email

souha.berriri@angers.inra.fr / julia.buitink@angers.inra.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Longévité, vigueur germinative, graine, Medicago truncatula, ABA, défense, GWAS

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

Longevity, vigor, seed, Medicago truncatula, ABA, defense, GWAS

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Le but de ce projet est de caractériser (caractérisation physiologique, moléculaire et biochimique) un gène de défense impliqué dans la régulation de la longévité des graines chez Medicago truncatula.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Analyse fonctionnelle chez Arabidopsis de gènes potentiellement impliqués dans la transmission du champignon nécrotrophe Alternaria brassicola de graine à la plantule.

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

Functional analysis of Arabidopsis candidate genes that potentially contribute to the transmission of the necrotrophic fungi Alternaria brassicicola from the seed to the plant during germination.

Statut de l'Unité de rattachement

UMR 1345 IRHS

Intitulé de l'équipe d'accueil

FUNGISEM

Responsable

Pascal POUPARD

Nom, prénom

Philippe GRAPPIN & Claire CAMPION

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

MCF

Adresse

Institut de Recherche en Horticulture et Semences UMR1345 (INRA / Agrocampus-ouest / Université d'Angers) Centre Angers-Nantes/ INRA-IRHS batiment A, 42 rue Georges Morel – BP 60057 49071 Beaucouzé cedex - France

Téléphone

0648006108

Email

philippe.grappin@agrocampus-ouest.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Arabidopsis seed, transgenerational pathogen transmission, seed physiopathology, phenotytping

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

Arabidopsis seed, transgenerational pathogen transmission, seed physiopathology, phenotytping

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Une analyse transcriptomique de l’interaction d’Alternaria brassicicola avec la graine d’Arabidopsis au cours de la germination a permis d’identifier des gènes candidats potentiellement impliqués dans le contrôle de la transmission du champignon nécrotrophe de la graine à la plantule. Il est proposé de réaliser l’analyse fonctionnelle de ces gènes par une approche de génétique moléculaire, de physiologie et de microscopie confocale. Des mutants d’insertion ADN-T d’Arabidopsis seront phénotypés pour leur sensibilité à Alternaria brassicicola au cours de la germination.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

A transcriptomic analysis of the interaction between Alternaria bracissicola and the Arabidopsis germinating seed identified candidate genes that potentially control transmission of the necrotrophic fungi from the seed to the seedling. In aim to validate this working model, functional genetic approach is proposed using T-DNA insertional Arabidopsis mutants and phenotyping assays to screen the susceptibility of the germinating seed to the Alternaria brassicicola strain.

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Le génotype est-il un bon prédicteur du phénotype chez Phytophthora infestans ?

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

Is genotype a good predictor of phenotype in Phytophthora infestans ?

Statut de l'Unité de rattachement

UMR 1349 IGEPP – INRA, Agrocampus Ouest,- Université Rennes 1

Intitulé de l'équipe d'accueil

Résistance et Adaptation

Responsable

Régine Delourme

Nom, prénom

Andrivon, Didier

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

DR, HDR

Adresse

UMR 1349 IGEPP – INRA centre de Rennes, Domaine de la Motte BP 35327, F-35653 Le Rheu Cedex

Téléphone

02 23 48 51 93

Email

Didier.Andrivon@inra.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Mildiou – Phénotype – Génotype – Trait d’histoire de vie – pouvoir pathogène

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

Late blight – Phenotype – Genotype – Life history trait – Pathogenicity

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Ce stage, combinant approches de pathologie végétale, microbiologie et génotypage, vise à analyser les liens entre profils génétiques et traits liés au pouvoir pathogène chez l’agent du mildiou de la pomme de terre Phytophthora infestans. Ces données sont importantes pour pouvoir piloter de nouvelles stratégies de lutte, en particulier celles reposant sur la résistance variétale, contre cette maladie majeure et forte consommatrice de pesticides.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

This project, combining techniques in plant pathology, microbiology and genotyping, aims to analyse the links between genetic profiles and life-history involved in pathogenicity in the potato late blight oomycete Phytophthora infestans. These data are important for the management of new control strategies, particularly those involving the use of cultivar resistance, targeting a major plant disease currently responsible for numerous pesticide applications.

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Étude du rôle d'effecteurs TALs dans l'interaction haricot/Xanthomonas

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

IRHS, UMR 1345 INRA, AgroCampus Ouest, Université d’Angers

Intitulé de l'équipe d'accueil

EmerSys (Emergence, Systématique, et écologie des bactéries associées aux plantes)

Responsable

Marie-Agnès Jacques

Nom, prénom

Chen, Nicolas

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

MCF

Adresse

IRHS-INRA, bâtiment C 42, rue Georges Morel 49071 Beaucouzé Cedex

Téléphone

0652923487

Email

nicolas.chen@agrocampus-ouest.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

phytopathologie, Xanthomonas, haricot, effecteurs TALs

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Les effecteurs Trans Activator-Like (TALs ou TALEs) sont des déterminants majeurs du pouvoir pathogène des Xanthomonas. Ces effecteurs sont capables d’entrer dans le noyau des cellules de l’hôte, de se fixer spécifiquement sur l’ADN en région promotrice de gènes de sensibilité, et d’en induire l'expression pour promouvoir l’infection. L’objectif de ce stage est d’étudier le rôle de plusieurs effecteurs TALs dans l’interaction haricot/Xanthomonas. En particulier, il s'agira d'étudier (i) si les TALEs jouent un rôle dans la sévérité de la maladie et (ii) quelles sont les gènes ciblés et induits par ces TALEs lors de l'infection.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Caractérisation biochimique d’enzymes marines du métabolisme du mannitol

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

UMR8227, CNRS-UPMC, Laboratoire de Biologie Intégrative des Modèles Marins

Intitulé de l'équipe d'accueil

Biologie des algues et interactions avec l’environnement

Responsable

Catherine Leblanc

Nom, prénom

Groisillier Agnes

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

IR

Adresse

Station Biologique, Place G. Teissier, 29680 ROSCOFF

Téléphone

0298292330

Email

groisill@sb-roscoff.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

algues marines, mannitol, analyse biochimique, stress salin, cristallogenèse

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Dans le contexte de l’étude du métabolisme secondaire chez l’algue brune Ectocarpus, ce stage visera à poursuivre la caractérisation biochimique des enzymes clés du cycle du mannitol qui pourrait jouer un rôle dans la résistance au stress salin chez cet organisme

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Etude du déterminisme moléculaire de l’accumulation en caroténoïdes en réponse aux stress biotiques et abiotiques chez la carotte

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

Molecular determinism of carrot carotenoid content in response to biotic and abiotic stresses

Statut de l'Unité de rattachement

UMR1345 IRHS (Institut de Recherche en Horticulture et Semences)

Intitulé de l'équipe d'accueil

Qualité et résistance aux maladies des espèces légumières (QuaRVeg)

Responsable

Briard Mathilde

Nom, prénom

GEOFFRIAU Emmanuel

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

MCF HDR

Adresse

INRA- UMR IRHS 42 rue Georges Morel – CS 60057 49071 Beaucouzé cedex - France

Téléphone

02.41.22.54.31

Email

emmanuel.geoffriau@agrocampus-ouest.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

régulation, transcriptomique, qualité, métabolites secondaires, modèle racine

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

L’application de stress (biotique/abiotique/combinés) se traduit par des variations de teneurs en caroténoïdes chez la carotte. L’objectif du stage est d’identifier des gènes et voies métaboliques impliqués dans l’accumulation en ces composés en réponse aux stress par une analyse de puce transcriptomique et de valider un modèle expérimental en conditions contrôlées dans la perspective d’étude plus précise des stress.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Analyse des fonctions dans les assemblages microbiens de la rhizosphère de Colza sous stress biotique

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

UMR

Intitulé de l'équipe d'accueil

Résistance et Adaptation

Responsable

R. Delourme

Nom, prénom

Sarniguet Alain

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

DR

Adresse

INRA Centre de Rennes UMR 1349 IGEPP INRA - Agrocampus Ouest - Université Rennes 1 Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes BP 35327 35653 Le RHEU Cedex FRANCE

Téléphone

33 2 23 48 51 94

Email

alain.sarniguet@inra.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

microbiote, métatranscriptome, rhizosphère, pathogène, fonctions

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

- tri et validation des pools de séquences ARNm bactériens - comparaison statistique des facteurs et identification de pools de transcrits différentiellement exprimés - assignation de fonctions - recherche bibliographique sur les implications des gènes transcrits dans le métabolisme et signalétique bactériens - identification fonctions associées et reliées au phénotype - choix et validation de "bioindicateurs" fonctionnels par qPCR

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Cell culture techniques have to be applied, including protoplast isolation and cell culture.

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

Direct transformation techniques by polyethylene glycol (PEG).

Statut de l'Unité de rattachement

UMR

Intitulé de l'équipe d'accueil

IGEPP Equipe RA (Résistance et Adaptation)

Responsable

Régine DELOURME

Nom, prénom

Laura CHAUVIN

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

IE

Adresse

INRA IGEPP Domaine de Keraiber 29600 Ploudaniel

Téléphone

0229626317

Email

laura.chauvin@inra.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

édition génique - nucléases site spécifique - pomme de terre-

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

genome engineering - Site-directed nucléases - potato-

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Le stage se déroulera sur le site INRA de Ploudaniel, dans les laboratoire de biologie cellulaire et moléculaire (IGEPP équipe Résistance et adaptation). Une serre S2 est également équipée pour accueillir des organismes génétiquement modifiées. Pour la réalisation de certaines techniques il faudra éventuellement prévoir des déplacements (les laboratoires IGEPP du site du Rheu, par exemple)

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Evaluation de la courbe critique de dilution de l’azote dans le cadre d’un couvert de gazon

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

Assesment of critical nitrogen dilution curve for turgrass

Statut de l'Unité de rattachement

INRA - URP3F

Intitulé de l'équipe d'accueil

Ecophysiologie

Responsable

Didier Combes

Nom, prénom

Combes Didier et Louarn Gaëtan

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

IR et CR

Adresse

Route de saintes BP 6 86600 Lusignan - France

Téléphone

05 49 55 60 91

Email

didier.combes@lusignan.inra.fr,gatean.louarn@lusignan.inra.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Gazon sportif, courbe de dilution azote, outil de diagnostic

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Le projet stage proposé porte sur l’étude de la validité de la courbe critique de dilution de l’azote dans le cadre de gazon sportif soumis à des tontes régulières.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Validation fonctionnelle des mécanismes activés par un stimulateur de défense à fort potentiel de protection chez le pommier.

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

UMR1345 IRHS (INRA/Agrocampus Ouest/Université d'Angers)

Intitulé de l'équipe d'accueil

Respom

Responsable

Charles Eric Durel

Nom, prénom

Degrave Alexandre

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

MCF

Adresse

42 rue Georges Morel - CS 60057, 49071 BEAUCOUZE CEDEX, FRANCE

Téléphone

0241225734

Email

alexandre.degrave@agrocampus-ouest.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Stimulateurs de défenses des plantes, pommier, Erwinia amylovora, validation fonctionnelle

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Le stage proposé par l’équipe Respom de l’IRHS (Institut de Recherche en Horticulture et Semences) d’Angers a pour but de valider l’implication des mécanismes identifiés suite à des analyses entreprises à l’échelle du génome sur des pommiers traités avec des stimulateurs de défenses. Cette validation fonctionnelle fera appel à une combinaison d’approches : moléculaires, biochimiques et microscopiques

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Modulation structurale et fonction biologique des mannanes au cours du développement du grain de blé

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

INRA UR1268 Biopolymères, Interactions, Assemblages

Intitulé de l'équipe d'accueil

Parois Végétales et Polysaccharides Pariétaux

Responsable

Fabienne Guillon, PhD

Nom, prénom

Yves Verhertbruggen

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

Chercheur post-doctorant

Adresse

Rue de la Geraudiere BP71627 44316 Nantes Cedex 03

Téléphone

0240675059

Email

yves.verhertbruggen@nantes.inra.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Parois cellulaires végétales Polysaccharides Grain de blé Biochimie des sucres Développement

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Le stage se déroulera au sein de l’INRA de Nantes, dans l’équipe « Parois Végétales et Polysaccharides Pariétaux ». Le projet Marie Curie dans lequel il sera intègré a pour but 1) de découvrir les enzymes impliquées dans la biosynthèse des mannanes, un polysaccharide présent dans les parois des grains de blé, et 2) de découvrir quels sont les structures biochimiques et les fonctions biologiques de ces mannanes dans le grain de blé.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Détection de QTL épigénétiques impliqués dans la résistance à la hernie chez Arabidopsis et étude de gènes candidats

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

Epigenetic QTL detection involved in Clubroot resistance in Arabidopsis and candidate gene analysis

Statut de l'Unité de rattachement

UMR IGEPP (Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes) – INRA, Agrocampus Ouest, Université Rennes 1

Intitulé de l'équipe d'accueil

Résistance et Adaptation

Responsable

Régine Delourme

Nom, prénom

Liégard Benjamin et Jubault Mélanie

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

Doctorant et MCF

Adresse

UMR1349 IGEPP, BP35327, 35653 Le Rheu cedex

Téléphone

0223485997 / 0223485475

Email

benjamin.liegard@inra.fr / melanie.jubault@agrocampus-ouest.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Plasmodiophora brassicae, méthylation, génétique quantitative, expression

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Le stage consistera en la détection de QTL épigénétiques de résistance à la hernie chez Arabidopsis et en l’étude / la validation de gènes candidats sous-jacents aux QTL détectés (expression, régulations épigénétiques).

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Caractérisation des galactosidases de la pomme

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

Unité BIA, Unité de recherche INRA

Intitulé de l'équipe d'accueil

Paroi Végétale et Polysaccharides Pariétaux

Responsable

Fabienne Guillon

Nom, prénom

Chateigner-Boutin, Anne-Laure

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

CR

Adresse

INRA-BIA-PVPP rue de la Géraudière 44000 Nantes

Téléphone

0240675059

Email

anne-laure.chateigner-boutin@nantes.inra.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Paroi cellulaire, texture des fruits, galactosidases, génétique fonctionnelle

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Ce stage propose d’étudier la fonction des gènes homologues à des galactosidases exprimées pendant le développement et la maturation de la pomme. Les galactosidases sont des enzymes impliquées dans le métabolisme des parois cellulaires, parois qui influencent la texture des fruits. Des approches de phylogénétique et de génétique fonctionnelle seront mises en œuvre pour appréhender la fonction de ces gènes.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Analyse fonctionnelle des gènes salivaires des pucerons potentiellement impliqués dans l'adaptation à la plante hôte

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

Functional analyses of aphid salivary genes that might be involved in host plant adaptation

Statut de l'Unité de rattachement

UMR 1349 Institut de Génétique Environnement et Protection des Plantes (IGEPP)

Intitulé de l'équipe d'accueil

EGI

Responsable

Jean-Christophe Simon

Nom, prénom

SUGIO, Akiko ; BOULAIN, Hélène

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

CR1 INRA, Doctorante

Adresse

UMR 1349 Institut de Génétique Environnement et Protection des Plantes (IGEPP) Domaine de la Motte, BP35327, 35657 Le Rheu

Téléphone

0223485153

Email

akiko.sugio@inra.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Interaction plante-puceron, effecteur, salive, adaptation à l’hôte

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

aphid-plant interactions, effector, saliva, host adaptation

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Au cours de ce stage, l’étudiant emploiera des outils avancés de biologie moléculaire pour étudier les interactions plante-puceron et identifier des facteurs du puceron qui sont impliqués dans l'alimentation générale des pucerons et l’adaptation à la plante hôte. Notre équipe étudie actuellement cette question par des approches combinées de biologie fonctionnelle et de biologie évolutive. Ce stage fait donc partie intégrante d’un large programme de recherche pluridisciplinaire et offre donc à l’étudiant/e une réelle opportunité d’être confronté/e à des approches variées mais complémentaires visant à comprendre les interactions plante-puceron et à élucider les mécanismes d’adaptation à la plante hôte au sein du complexe de biotypes du puceron du pois.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

In this course, a student will employ advanced molecular biology tools to study plant-aphid interactions and envisage identifying the aphid factors that are involved in aphid general feeding and in host plant adaptation. Currently, the team is investigating this question using population biology and evolutionary biology. Thus, this course is a part of a large multidisciplinary program and will provide student with a great opportunity to be exposed to various aspects of plant-aphid interactions and different views to elucidate the host adaptation mechanisms in the pea aphid complex.

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Diversité, égalité, fraternité : mobilisation de la modélisation pour analyser les relations entre plantes dans les prairies multi-espèces hébergeant des légumineuses

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

Unité de recherche INRA(UR4)

Intitulé de l'équipe d'accueil

Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères – Equipe écophysiologie

Responsable

Didier Combes

Nom, prénom

Louarn, Gaëtan

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

CR1

Adresse

INRA, BP6, 86600 Lusignan

Téléphone

0549556063

Email

gaetan.louarn@lusignan.inra.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

légumineuses, graminée, modélisation, compétition, diversité

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Les objectifs du stage sont de hiérarchiser l’importance de différents mécanismes stabilisateurs au sein des communautés prairiales pouvant expliquer la meilleure performance des prairies multi-espèces. Le modèle « Virtual Grassland », développé pour analyser les relations de compétition/facilitation dans les communautés prairiales, sera utilisé pour explorer in silico une gamme de situations variant selon trois gradients : compétition pour la lumière, facilitation pour l’N et divergence des réponses au stress hydrique. Le travail débouchera sur l’identification de combinaisons de traits favorables pour différents contextes pédoclimatiques.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Rôle d’un métabolite secondaire hydrophobe dans le pouvoir pathogène du champignon nécrotrophe Alternaria dauci.

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

UMR

Intitulé de l'équipe d'accueil

FungiSem

Responsable

Pascal Poupard

Nom, prénom

Berruyer Romain

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

MCF

Adresse

2, Bd Lavoisier, 49045 Angers. Cedex

Téléphone

02 41 22 54 52

Email

romain.berruyer@univ-angers.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

carrote alternaria toxines synthèse analyse

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

De fortes corrélations ont été trouvées entre le niveau d’agressivité des souches d’A. dauci sur carotte et la production par ces souches d’un composé liposoluble qui est en cours d’analyse. Ces résultats laissent à penser que ce composé est d’une grande importance dans l’interaction. L’objectif premier du stage est de mieux connaitre le rôle de ce composé dans l’interaction. La production du composé par différentes souches d’A. dauci sera quantifiée in vitro et in planta. Le mycélium produit par le champignon sera de plus utilisé pour analyser par qPCR le niveau d’expression des gènes codant pour des PKS.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Implication du transporteur de nitrate, AtNPF6.3, dans la résistance des plantes au stress biotique via le pathosystème Arabidopsis thaliana / Alternaria brassicicola

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

IRHS UMR 1345 - INRA/ACO/Université d’Angers

Intitulé de l'équipe d'accueil

SESaN (Seedling Establishment, Stress and Nitrogen)

Responsable

Anis LIMAMI

Nom, prénom

PLANCHET Elisabeth

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

MCF

Adresse

IRHS Campus du Végétal 42 rue Georges Morel BP 60057 49071 Beaucouzé Cedex

Téléphone

02.49.18.04.76

Email

elisabeth.planchet@univ-angers.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Signalisation par le nitrate, absorption du nitrate, métabolisme azoté, transcepteur, stress fongique.

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

Le projet vise à (i) déterminer l’implication du nitrate et d’un transporteur de nitrate (AtNPF6.3) dans la relation entre le statut métabolique azoté chez la plante modèle Arabidopsis thaliana et la sensibilité/résistance à une infection fongique via Alternaria brassicicola et (2) investir les voies de signalisation dépendantes de AtNPF6.3 en réponse à ce champignon nécrotrophe.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)

 

 

Intitulé du sujet de stage (version française)

Evolution de la spécificité symbiotique fixatrice d'azote chez les lupins (Fabacées): Analyse de l'expression de gènes candidats

Intitulé du sujet de stage (version anglaise facultative)

 

Statut de l'Unité de rattachement

UMR 6553 ECOBIO, Université de Rennes 1/CNRS

Intitulé de l'équipe d'accueil

Évolution, génomes, adaptation (EGA)

Responsable

Malika AÏNOUCHE

Nom, prénom

Cabello-Hurtado, Francisco ; Aïnouche, Abdelkader

Qualité (CR, DR, MCF, PR, autres)

MCF-HDR ; MCF

Adresse

Campus de Beaulieu Bât14A – 35042 Rennes

Téléphone

0223235022 ; 0223236119

Email

francisco.cabello@univ-rennes1.fr ; abdelkader.ainouche@univ-rennes1.fr

Mots clé (version française 5 maximum)

Spécificité symbiotique, Lupinus, Transcriptomique, Phylogénie

Mots clé (version anglaise facultative 5 maximum)

 

Descriptif du stage (version française 5 lignes maximum)

L’objectif est d’identifier les gènes symbiotiques déterminants de la spécificité symbiotique, et d’étudier leur évolution moléculaire. Le système expérimental de travail est basé sur 3 espèces de lupin cultivées en présence d’une bactérie compatible (symbiose fonctionnelle) ou non. L’étudiant(e) aura pour mission d’étudier l’expression (qPCR) des gènes symbiotiques montrant des variations d’expression significative en fonction du symbionte présent. Ensuite, il analysera l’histoire évolutive de chaque gène symbiotique d’intérêt dans le contexte générale de leur évolution chez les légumineuses.

Descriptif du stage (version anglaise facultative 5 lignes maximum)